两个品种马骨髓基因表达谱分析

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2016.05.008

畜牧兽医学报 ›› 2016, Vol. 47 ›› Issue (5): 922-930.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.05.008

两个品种马骨髓基因表达谱分析

赵一萍，张宇宏，李蓓，黄金龙，白东义，赵启南，乌尼尔夫，杨丽华，吴敬，乌云达来，芒来^*

（内蒙古农业大学动物科学学院，内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室，呼和浩特 010018）

收稿日期:2015-05-04 出版日期:2016-05-23 发布日期:2016-05-23
通讯作者: 芒来，教授，博士生导师，主要从事马属动物种质资源创新与遗传改良研究，Tel：0471-4316151，E-mail：dmanglai@163.com
作者简介:赵一萍（1984-），女，满族，河北高碑店人，博士，助理研究员，主要从事马遗传育种与繁殖研究， E-mail：yipingzhao@imau.edu.cn
基金资助:
内蒙古自治区科技厅重点实验室建设项目（20130902）；内蒙古自治区科技厅应用技术研究与开发项目（20140172）；内蒙古自治区自然科学基金项目（2015BS0316）

Analysis of Gene Expression Profile of Bone Marrow in Two Horse Breeds

ZHAO Yi-ping，ZHANG Yu-hong，LI Bei，HUANG Jin-long，BAI Dong-yi，ZHAO Qi-nan，SHIRAIGO Wunierfu，YANG Li-hua，WU Jing，BAO Wuyundalai，DUGARJAVIIN Mang-lai^*

(Inner Mongolia Mongolian Horse Genetic Resources Protection and Industrial Engineering Laboratory，College of Animal Science，Inner Mongolia Agricultural University，Hohhot 010018，China)

Received:2015-05-04 Online:2016-05-23 Published:2016-05-23

摘要/Abstract

摘要：

为了寻找不同品种马骨髓之间的差异表达基因，本研究构建了蒙古马-骨髓和纯血马-骨髓基因表达谱文库，经Illumina Miseq高通量测序，分别获得了7 219 956和7 116 170个有效reads；两个文库映射到11、8和1号染色体的reads最多，而映射到29、30和31号染色体的reads最少；两个文库共筛出318个差异表达基因，其中与免疫相关的基因有21个。GO功能富集分析结果表明差异表达基因与转运、细胞间信号传导、生物学过程和细胞质等有关；KEGG通路富集分析结果表明，差异最大的显著富集KEGG条目为神经系统。这些结果为研究马匹抗病力的遗传和免疫机理等提供基础数据。

Abstract:

To investigate the differential genes expression of bone marrow between different horse breeds，expression profiling libraries of Mongolian Horse-bone marrow and Thoroughbred-bone marrow were constructed.We obtained 7 219 956 and 7 116 170 useful reads by the Illumina Miseq sequencing，respectively.The most of reads in the 2 expression profiling libraries were maped on chromosome 11，chromosome 8 and chromosome 1，and the least of reads were maped on chromosome 29，chromosome 30 and chromosome 31.318 differentially expressed genes were found in 2 expression profiling libraries，including 21 immune-related genes.The Gene Ontology analysis showed that the differentially expressed genes were related to transport，cell-cell signaling，biological process and cytoplasm，etc.The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analysis indicated that nervous system was the most differentiated KEGG term.These results will provide data basis for further studies on the horses disease resistance and immune mechanism.

中图分类号:

S821.2

赵一萍，张宇宏，李蓓，黄金龙，白东义，赵启南，乌尼尔夫，杨丽华，吴敬，乌云达来，芒来. 两个品种马骨髓基因表达谱分析[J]. 畜牧兽医学报, 2016, 47(5): 922-930.

ZHAO Yi-ping，ZHANG Yu-hong，LI Bei，HUANG Jin-long，BAI Dong-yi，ZHAO Qi-nan，SHIRAIGO Wunierfu，YANG Li-hua，WU Jing，BAO Wuyundalai，DUGARJAVIIN Mang-lai. Analysis of Gene Expression Profile of Bone Marrow in Two Horse Breeds[J]. ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA, 2016, 47(5): 922-930.

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